--- misc/Makefile.in
+++ misc/Makefile.in
@@ -73,7 +73,7 @@
 INSTALL_SCRIPT	= @INSTALL_SCRIPT@
 INSTALL_DATA	= @INSTALL_DATA@
 
-PKG_CONFIG_LIBDIR = @PKG_CONFIG_LIBDIR@
+PKG_CONFIG_LIBDIR = $(patsubst $(DESTDIR)%,%,@PKG_CONFIG_LIBDIR@)
 
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